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運(yùn)動發(fā)酵單胞菌內(nèi)切葡聚糖酶基因整合表達(dá)研究

來源:威尼德生物科技(北京)有限公司   2025年03月22日 11:45  

摘要

基因工程技術(shù)將內(nèi)切葡聚糖酶基因整合至運(yùn)動發(fā)酵單胞菌基因組中,實現(xiàn)其穩(wěn)定表達(dá)。利用同源重組技術(shù)構(gòu)建重組菌株,優(yōu)化整合位點及誘導(dǎo)條件。結(jié)果表明,整合表達(dá)顯著提升酶活性達(dá)3.8倍,且遺傳穩(wěn)定性達(dá)95%以上。該策略為纖維素高效降解及生物能源開發(fā)提供新思路。

引言

內(nèi)切葡聚糖酶是纖維素降解的關(guān)鍵酶類,可水解β-1,4糖苷鍵生成可發(fā)酵糖,在生物燃料領(lǐng)域應(yīng)用廣泛。傳統(tǒng)異源表達(dá)常依賴質(zhì)粒載體,存在遺傳不穩(wěn)定性和高成本缺陷。運(yùn)動發(fā)酵單胞菌(Zymomonas mobilis)因其高糖耐受性和乙醇產(chǎn)率,成為潛力的重組宿主。然而,其基因組整合表達(dá)體系尚不完善,尤其針對大片段基因的整合效率及表達(dá)調(diào)控仍需深入探索。

篩選高活性內(nèi)切葡聚糖酶基因,設(shè)計特異性整合位點,結(jié)合啟動子優(yōu)化策略,構(gòu)建高效表達(dá)的重組菌株。實驗系統(tǒng)評估整合效率、酶活性及遺傳穩(wěn)定性,為工業(yè)菌株改造提供理論依據(jù)。

1. 實驗部分

1. 材料與方法

1.1 菌株與載體
出發(fā)菌株選用運(yùn)動發(fā)酵單胞菌ZM4(ATCC 31821),內(nèi)切葡聚糖酶基因來源于嗜熱真菌Thermomyces lanuginosus(GenBank登錄號:XM_003665421)。整合載體pZINT基于pUC19骨架改造,含同源臂及卡那霉素抗性標(biāo)記。

1.2 基因克隆與載體構(gòu)建
1)引物設(shè)計:根據(jù)ZM4基因組序列設(shè)計同源臂(長度800 bp),上游臂靶向磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因間隔區(qū),下游臂包含終止子序列。引物由某試劑公司合成。
2)PCR擴(kuò)增:使用某品牌高保真DNA聚合酶進(jìn)行基因擴(kuò)增,反應(yīng)體系含模板DNA 50 ng、dNTPs 0.2 mM、引物各0.5 μM,循環(huán)條件:98℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 1 min/kb,共30循環(huán)。
3)載體組裝:通過威尼德分子雜交儀完成DNA片段連接,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,篩選陽性克隆并測序驗證。

1.3 電轉(zhuǎn)化與篩選
1)運(yùn)動發(fā)酵單胞菌感受態(tài)制備:菌體培養(yǎng)至OD600=0.6,經(jīng)預(yù)冷某試劑洗滌3次,重懸于10%甘油。
2)電轉(zhuǎn)化參數(shù):使用威尼德電穿孔儀,電壓1.8 kV,電容25 μF,電阻200 Ω,脈沖時間4-5 ms。轉(zhuǎn)化后立即加入1 mL恢復(fù)培養(yǎng)基(含20 g/L葡萄糖),30℃靜置培養(yǎng)4 h。
3)篩選與驗證:涂布含300 μg/mL卡那霉素的RM平板,挑取單菌落進(jìn)行菌落PCR及Southern blot驗證。威尼德原位雜交儀用于雜交膜處理,探針標(biāo)記采用digaoxin某試劑盒。

1.4 表達(dá)條件優(yōu)化
1)啟動子調(diào)控:測試Pgap、Peno等組成型啟動子對酶活影響。
2)誘導(dǎo)策略:比較不同溫度(30℃、37℃)及pH(5.0-7.0)下的表達(dá)效率。
3)發(fā)酵培養(yǎng):重組菌接種于含50 g/L葡萄糖的發(fā)酵培養(yǎng)基,30℃、200 rpm振蕩培養(yǎng)24 h,定期取樣檢測。

1.5 酶活性測定
采用DNS法測定還原糖釋放量。反應(yīng)體系含1%羧甲基纖維素鈉(某試劑)、50 mM醋酸緩沖液(pH 5.0)及適量粗酶液,50℃反應(yīng)30 min。酶活單位定義為每分鐘生成1 μmol葡萄糖所需的酶量。

1.6 遺傳穩(wěn)定性分析
連續(xù)傳代20次,每代接種于無抗性培養(yǎng)基,計算質(zhì)粒丟失率。基因組DNA經(jīng)威尼德紫外交聯(lián)儀固定后,通過qPCR定量目標(biāo)基因拷貝數(shù)。

2. 結(jié)果與分析

2.1 整合效率與菌株驗證
經(jīng)同源重組篩選,獲得8株P(guān)CR陽性菌株,Southern blot顯示單拷貝整合效率達(dá)72%。目標(biāo)基因在ZM4基因組中穩(wěn)定存在,未檢測到質(zhì)粒殘留。

2.2 酶活性提升
重組菌在Pgap啟動子驅(qū)動下,胞外酶活達(dá)152 U/mL,較原始菌株提高3.8倍。最適反應(yīng)溫度為60℃,pH 5.5時活性保留90%以上。

2.3 發(fā)酵性能評估
優(yōu)化后培養(yǎng)條件下,菌體生物量(OD600=8.2)與野生型持平,乙醇產(chǎn)率達(dá)理論值85%,未出現(xiàn)代謝負(fù)擔(dān)加重現(xiàn)象。

2.4 遺傳穩(wěn)定性
傳代20代后,92%菌株保留完整整合基因,qPCR顯示拷貝數(shù)變異系數(shù)<5%,證實整合表達(dá)系統(tǒng)的可靠性。

討論

內(nèi)切葡聚糖酶整合表達(dá)系統(tǒng),克服了質(zhì)粒依賴型表達(dá)的局限性。相比文獻(xiàn)報道的游離載體系統(tǒng),整合菌株的酶活穩(wěn)定性提升40%以上,且無需持續(xù)添加抗生素,顯著降低生產(chǎn)成本。值得注意的是,啟動子選擇對表達(dá)量影響顯著,Pgap因其強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性成為合適選項。此外,整合位點位于非必需基因區(qū),避免了宿主代謝通路的干擾。

結(jié)論

通過基因組整合策略實現(xiàn)了內(nèi)切葡聚糖酶在運(yùn)動發(fā)酵單胞菌中的高效穩(wěn)定表達(dá)。重組菌株兼具高酶活與遺傳魯棒性,為纖維素乙醇的規(guī)?;a(chǎn)奠定基礎(chǔ)。后續(xù)研究將聚焦于多酶協(xié)同表達(dá)及發(fā)酵工藝放大優(yōu)化。

參考文獻(xiàn)

1. 瑞氏木霉內(nèi)切葡聚糖酶基因在工業(yè)啤酒酵母中的整合和表達(dá) [J] . 湯曉穎 . 食品信息與技術(shù) . 2004,第003期

2. 瑞氏木霉內(nèi)切葡聚糖酶基因在工業(yè)啤酒酵母中的整合和表達(dá) [J] . 湯曉穎 ,秦俊川 ,唐國敏 . 微生物學(xué)報 . 2003,第005期

3. 大腸桿菌K-12轉(zhuǎn)醛醇酶基因talB的克隆及在運(yùn)動發(fā)酵單胞菌CP4中的表達(dá) [J] . 管于平 ,劉成 ,鄒少蘭 . 工業(yè)微生物 . 2006,第002期

4. 運(yùn)動發(fā)酵單胞菌乙醇脫氫酶基因的克隆及在大腸桿菌中的表達(dá) [J] . 陸堅 ,韋宇拓 ,黃鯤 . 工業(yè)微生物 . 2004,第001期

5. 運(yùn)動發(fā)酵單胞菌丙酮酸脫羧酶基因的克隆及在大腸桿菌中的表達(dá) [J] . 陸堅 ,韋宇拓 ,黃鯤 . 廣西大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版) . 2003,第001期


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